一、性质上不同:
1、个人独资企业一般视为有限责任公司，注册场地，注册资金、账务、董监高要求都是按照公司制度来。企业能够证明自身资金与独资人财产不混同时，享有只承担注册资金范围内的有限责任。
2、个体工商户可以没有企业名称,也可以没有固定的经营场所。非有限责任团体，
其经营者承担无限连带责任。
二、投资者与经营者的变通性:
1、独资企业是个人出资经营、归个人所有控制、由个人承担经营风险和享有全部经营收益
2、个人独资企业可以设立分支机构,就是说可以设立分公司和子公司;
3、个体工商户根据规定是不可以设立分支机构的,总的来说个人独资企业会比个体工商户的规模大一些.
四、财务制度和税收政策不同:
1、个人独资企业必须建立财务制度,进行会计核算.
2、个体工商户在是否建立会计制度上存在许多争议,从执法情况下来看,体工商户可以按照税务机关的要求建立账簿,如税务部门不作硬性要求,也可以不进行会计核算.
五、税收方面:
个人独资企业算是一个企业,所以一般都是一般纳税人,个体工商户大部分都是小规模纳税人,有需要的情况下也可以申请为一般纳税人.